Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nme8Q715T0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms