Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NinlQ6ZQ12 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinlQ6ZQ12 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms