Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chsy1Q6ZQ11 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms