Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms