Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc154Q6RUT8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms