Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms