Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpsf6Q6NVF9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms