Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms