Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ParpbpQ6IRT3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ParpbpQ6IRT3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms