Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop58Q6DFW4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms