Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q6DFW0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms