Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb1Q64318 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms