Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6eQ64253 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ly6eQ64253 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6eQ64253 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms