Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup62Q63850 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms