Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
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Hoxa13Q62424 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Hoxa13Q62424 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Hoxa13Q62424 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Hoxa13Q62424 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Hoxa13Q62424 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Hoxa13Q62424 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Hoxa13Q62424 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa13Q62424 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Hoxa13Q62424 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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