Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms