Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3bQ62177 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3bQ62177 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms