Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Erbb3Q61526 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erbb3Q61526 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb3Q61526 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms