Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
PcolceQ61398 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms