Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcanQ61361 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcanQ61361 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcanQ61361 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms