Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kpna1Q60960 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms