Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ItgaeQ60677 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ItgaeQ60677 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms