Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprnQ60673 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprnQ60673 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprnQ60673 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprnQ60673 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprnQ60673 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprnQ60673 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprnQ60673 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprnQ60673 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprnQ60673 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprnQ60673 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprnQ60673 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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PtprnQ60673 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PtprnQ60673 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PtprnQ60673 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprnQ60673 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms