Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NotoQ5TIS6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NotoQ5TIS6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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