Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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