Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
D130052B06RikQ3UW13 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
D130052B06RikQ3UW13 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms