Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms