Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Yipf3Q3UDR8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms