Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kdm4dQ3U2K5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms