Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc174Q3U155 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc174Q3U155 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms