Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc9Q3U0M1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms