Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tamm41Q3TUH1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms