Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms