Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 NYV1YLR093C 762 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 ARC18YLR370C 537 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 ADI1YMR009W 540 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YMR181CYMR181C 465 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 GAL7YBR018C 1101 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YOR364WYOR364W 369 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YKL075CYKL075C 1353 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YCL019WYCL019W 5313 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 FLO1YAR050W 4614 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 FUN30YAL019W 3396 nt2.95□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 MET5YJR137C 4329 nt2.94□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 snR84snR84 550 nt2.94□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 MTC7YEL033W 420 nt2.94□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.94□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 SAE2YGL175C 1038 nt2.94□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YKE2YLR200W 345 nt2.94□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YNL089CYNL089C 477 nt2.94□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 RCN2YOR220W 798 nt2.94□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 PUF6YDR496C 1971 nt2.93□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YCR108CYCR108C 192 nt2.93□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.93□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 PAI3YMR174C 207 nt2.93□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 DYN3YMR299C 939 nt2.93□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YNL235CYNL235C 432 nt2.93□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YPR170CYPR170C 336 nt2.93□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YAK1YJL141C 2424 nt2.93□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 RAX2YLR084C 3663 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 NOP12YOL041C 1380 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 ATP6Q0085 780 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 GIC1YHR061C 945 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YET1YKL065C 621 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 SRP21YKL122C 504 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 MCR1YKL150W 909 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 CDC123YLR215C 1083 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 TAP42YMR028W 1101 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 GRE2YOL151W 1029 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YPL276WYPL276W 438 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 NAB6YML117W 3405 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YNL193WYNL193W 1677 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 TCB2YNL087W 3537 nt2.92□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 BAT1YHR208W 1182 nt2.91□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YAP5YIR018W 738 nt2.91□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 RPL20AYMR242C 519 nt2.91□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 RPL20BYOR312C 519 nt2.91□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 YPL107WYPL107W 747 nt2.91□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 BRE5YNR051C 1548 nt2.91□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 LST4YKL176C 2487 nt2.91□□□□□ -1.94
CTF3Q12748 DNA2YHR164C 4569 nt2.9□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 BUD4YJR092W 4344 nt2.9□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 NTF2YER009W 378 nt2.9□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 SLX9YGR081C 633 nt2.9□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 MVB12YGR206W 306 nt2.9□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YGR290WYGR290W 444 nt2.9□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 RPL17BYJL177W 555 nt2.9□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.9□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 RPL23AYBL087C 414 nt2.9□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 MRPL40YPL173W 894 nt2.9□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 SEN54YPL083C 1404 nt2.9□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 FAR1YJL157C 2493 nt2.9□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 TFB1YDR311W 1929 nt2.89□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 NMA111YNL123W 2994 nt2.89□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 PEA2YER149C 1263 nt2.89□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 RGR1YLR071C 3249 nt2.89□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 ASI3YNL008C 2031 nt2.89□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 BOI1YBL085W 2943 nt2.89□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 RBL2YOR265W 321 nt2.89□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YOR385WYOR385W 873 nt2.89□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 BUB1YGR188C 3066 nt2.89□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YHR078WYHR078W 1659 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 ITC1YGL133W 3795 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YDL016CYDL016C 303 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YDR262WYDR262W 819 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 VMA8YEL051W 771 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 LRP1YHR081W 555 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 SDL1YIL167W 633 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YJL119CYJL119C 324 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 ASG7YJL170C 630 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YLR379WYLR379W 375 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 ATP19YOL077W-A 207 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 PET123YOR158W 957 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 AFT2YPL202C 1251 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 SEC66YBR171W 621 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 PSY2YNL201C 2577 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 TSC11YER093C 4293 nt2.88□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 NSA1YGL111W 1392 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 SLK19YOR195W 2466 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YOL057WYOL057W 2136 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 JJJ2YJL162C 1752 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 DOA4YDR069C 2781 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YAT2YER024W 2772 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 GYP7YDL234C 2241 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 NCB2YDR397C 441 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 YDR442WYDR442W 393 nt2.87□□□□□ -1.95
CTF3Q12748 RRT13YER066W 558 nt2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.8 ms