Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms