Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox8Q04886 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox8Q04886 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms