Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Grin2cQ01098 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms