Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms