Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scn1bP97952 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms