Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2cP97760 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr2cP97760 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms