Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Taf1bP97358 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Taf1bP97358 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Taf1bP97358 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1bP97358 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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