Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf1P84078 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf1P84078 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms