Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HpcaP84075 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HpcaP84075 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms