Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx1P82976 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbx1P82976 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbx1P82976 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms