Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms