Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp2P63044 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp2P63044 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp2P63044 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp2P63044 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp2P63044 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp2P63044 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp2P63044 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp2P63044 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp2P63044 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp2P63044 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp2P63044 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp2P63044 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp2P63044 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp2P63044 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp2P63044 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms