Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vsnl1P62761 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vsnl1P62761 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms