Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch1P62046 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms