Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms