Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1aP61092 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1aP61092 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Siah1aP61092 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1aP61092 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1aP61092 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1aP61092 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1aP61092 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1aP61092 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1aP61092 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1aP61092 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1aP61092 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1aP61092 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Siah1aP61092 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1aP61092 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1aP61092 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1aP61092 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1aP61092 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1aP61092 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1aP61092 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Siah1aP61092 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1aP61092 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1aP61092 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1aP61092 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1aP61092 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1aP61092 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1aP61092 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1aP61092 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1aP61092 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1aP61092 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1aP61092 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1aP61092 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah1aP61092 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah1aP61092 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Siah1aP61092 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah1aP61092 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah1aP61092 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1aP61092 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms